การทำความสะอาดภายในช่องปากด้วยการแปรงฟันนั้น อาจจะไม่เพียงพอ เนื่องจากขนแปรงไม่สามารถซอกซอนเข้าไปทำความสะอาดบริเวณซอกฟันได้ ทำให้เกิดการสะสมของเศษอาหารและแผ่นคราบจุลินทรีย์ ทำให้เกิดฟันผุบริเวณซอกฟันได้
ดังนั้นจึงควรใช้ไหมขัดฟัน ช่วยทำความสะอาดในซอกฟันที่แปรงสีฟันเข้าไปไม่ถึง โดยควรใช้ภายหลังการทานอาหาร หรืออย่างน้อยวันละ 1 ครั้งหลังการแปรงฟันในตอนเย็น